Ya está disponible para su descarga la versión 1.2 del widget gratuito ProteinGlimpse. ProteinGlimpse 1.2 es el único widget que existe hoy en día que permite recuperar y mostrar en tres dimensiones, no sólo aquellas macromoléculas contenidas en la base de datos RCSB PDB, sino también, las moléculas -cuyos archivos con la información estructural necesaria- sean reconocidas por Jmol. Para ello únicamente se deberá arrastrar y soltar el fichero sobre el widget.
Este widget resulta de una inestimable ayuda, tanto para los investigadores, profesores y estudiantes en la ramas de la biología, química y la medicina, como para cualquiera que se sienta fascinado por este mundo molecular.
Te lo puedes descargar del aquí.
Esta aplicación del Dashboard utiliza el applet de Jmol < http://jmol.sourceforge.net/ > como motor de visualización.
Además se ha implementado en esta versión una nueva forma de visualización llamada «balls and sticks» y se ha mejorado enormemente el interfaz gráfico gracias a la inestimable colaboración de Daniel Gasco Rodríguez y ha sido desarrollada por Jaime Fernández Vera.
Los requisitos de sistema son:
Mac OS X Tiger (10.4x ) o superior y, para poder bajarse las macromoléculas de la base de datos RCSB PDB, conexión a Internet.
Si no está familiarizado con las proteínas puede encontrar algunos ejemplos a continuación:
– La hormona de la insulina, código: 1APH
– La doble hélice de ADN en su forma B: 1BNA
– El canal de potasio: 1BL8 (una proteína de membrana)
– ARN tranferente: 4TNA
– Una proteasa del virus del sida (HIV )con su inhibidor: 4PHV
– La inosina monofosfato dehidrogenasa complejada con el ácido micofenólico: 1JR1
Puedes encontrar más información (en inglés) sobre el widget en el siguiente enlace: http://homepage.mac.com/eludens/html/ProteinGlimpse.html
Enhorabuena una vez más Jaime.
Durante mucho tiempo trabajamos con José Luis haciendo modelos para Chime y el ver cómo agonizaba tras el parón de desarrollo de MDL nos entristecía cada día. Sin embargo desde que Miguel se hizo cargo del desarrollo de JMOL y ahora con vosotros, y cosas como esta pequeña utilidad nos ilusiona de nuevo.
Has vuelto a dar en el Clavo.
Un abrazo.
Gracias José Francisco.
Un abrazo,
¡¡Felicidades campeón!! Eres un hacha 🙂
Para facilitar la inservión de modelos en una pagian web, he creado un webservice que facilmente permite a un usuario inexperto añadir el visor Jmol de cualquier molecula existente en la base de datos. La dirección és: http://phobos.xtec.net/fmas