Si lo que quieres es eliminar el Historial y nada más, en la opción de menú Historial, al final tienes Borrar Historial que no es más que una duplicación aproximada de las opciones que tienes en el menú Safari. Ahora, pulsa la tecla ⌥ y esa opción cambiará permitiéndote borrar solo el historial pero respetando cookies y datos de sitios web.
Este truco se lo he visto a @Marc_intosh
Gracias. Resulta más que interesante poder eliminar historial demasiado viejo, que no vamos a ir a consultar. No entiendo por qué han tenido que retorcer tanto el asunto, borrar el historial no es querer borrar todo. A veces no sé por qué son tan retorcidos y complican cosas que eran muy simples y estaban bien como estaban.