Parece que si usaste CPAN para mejorar tu instalación por defecto de Perl, entonces la actualización Security Update 2009-001 «mata» a Perl, de manera que tus scripts no se ejecutarán. Hay una discusión sobre esto en el los foros de soporte de Apple.
El arreglo mencionado en ese hilo funcionó para un usuario y es lo siguiente, todo hecho en la Terminal:
$ mkdir -p /SourceCache
$ cd /SourceCache
$ curl -O http://cpan.mirror.solnet.ch/authors/id/G/GB/GBARR/IO-1.2301.tar.gz
$ tar xzf IO-1.2301.tar.gz
$ cd IO-1.2301
$ perl Makefile.PL
$ make
$ make install
Haz notar que para algunos de los comandos anteriores, necesitas estar identificado como root, o ejecutarlo usando sudo.
Fuente: Mac OS X Hints