Apple diseñó el iPod para funcionar principalmente en combinación con su programa iTunes. Con iTunes, se puede automáticamente sincronizar la música de la biblioteca del usuario con la del iPod cada vez que se conecta al ordenador. Las canciones, fotos y listas de reproducción nuevas se copian automáticamente al iPod y las canciones borradas son eliminadas también del iPod. Esto funciona también en sentido inverso, si se valora una canción en el iPod, la calificación se copiará a la biblioteca de iTunes.
Además si se escuchan audiolibros, la posición de éstos también se sincronizará automáticamente. iTunes da la opción de sincronización manual y esta sincronización manual es la que vamos a utilizar para poder disponer de nuestra Biblioteca de iTunes, estemos donde estemos, gracias a nuestro iPod, el cual conectaremos en un equipo. No necesitaremos otra cosa que conectar nuestro iPod o iPhone al equipo y a funcionar.
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