Y así corregir un grave problema.
Este problema, reconocido en la base de datos de soporte de Filemaker, provocaba que los archivos no se cerraran correctamente antes de apagar el programa.
La nueva actualización 5.5v4 corrige este grave fallo.
Si buscas en la web de FileMaker esa actualización la encontrarás, aunque todavía no hay anuncio oficial de ella.