Las pilas de ventanas se activan al marcar una casilla en el Panel de Control de Mission Control en Preferencias del Sistema.
Al activar esta opción, cuando invocas Mission Control las ventanas de una sola aplicación se muestran agrupadas con un icono debajo.
Si prefieres este método de agrupación de ventanas en lugar de las ventanas independientes, un buen truco: si pinchas en el icono que identifica a todas las ventanas y arrastras, te llevarás todas las ventanas por ejemplo a un espacio nuevo.