iOS 9.3 puede considerarse como una actualización mayor e incluye, además de las mejoras de rendimiento y estabilidad, características mayores para los usuarios.
Así con esta actualización se incluirá el modo nocturno que permite cambiar la temperatura de color de la pantalla y hacerla más agradable en la oscuridad. También se añade la posibilidad de proteger Notas con contraseña o con el uso de TouchID. Las notas seguras solo estarán disponibles en iOS 9.3 y OS X 10.11.4 El Capitan sin compatibilidad con iCLoud.com de momento.
Los usuarios del iPhone 6s y 6s Plus recibirán además acciones adicionales para 3D Touch con acceso a información sobre hardware y servicios.
