Este año que viene terminará Atlantis con 5 temporadas a su espalda, aunque la serie continuará con una película especial de dos horas para televisión.
En la nueva serie, tras desbloquear el misterioso chevron número 9, un equipo de exploradores viajarán a una nave espacial llamada Destiny, lanzada por los Antiguos en la cumbre de su civilización como un gran experimento que no se llegó a completar.
Lo que se inició como un simple reconocimiento del terreno se convierte en una misión sin fin puesto que descuben que la nave no puede volver a la tierra y han de hacerlo ellos por sus propios medios. El Destiny deberá viajar a los extremos del Universo, conectando con los StarGatews lanzados con anterioridad para poder finalizar el experimento de los Antiguos y poder volver a casa.