Estos archivos descargados, cuando son ejecutables o pueden serlo (como las aplicaciones o archivos .php) pueden ser potencialmente inseguros y al abrirlos, el sistema operativo lanza un cuadro de diálogo la primera vez que se intentan ejecutar, ya sea desde el Finder, desde spotlight o desde el Dock solicitando la aprobación del usuario.
Generalmente, si cancelas la apertura de la aplicación, la siguiente vez que trates de abrirla, volverá a solicitar la aprobación de el usuario. En el caso de una aplicación que compartirán múltiples usuarios en su Mac, solo el usuario que descargó la aplicación puede eliminar la cuarentena de forma definitiva, mientras que otros usuarios del mismo ordenador recibirán el cuadro de diálogo siempre que intenten abrir la aplicación y deberán aceptar la apertura del archivo en cuestión cada vez que abran el archivo en cuestión.
Así que si una aplicación que consideras seguro, pero te te da la lata con este cuadro de diálogo cada vez que la intentas abrir, con toda seguridad lo que ocurre es que lo descargaste con otro usuario y deberás identificarte como tal para poder sacarlo de la cuarentena y no recibir mas cuadros de diálogo solicitando permiso para abrirla.