Haz un disco de arranque compatible con Time Machine

Comenzando con un disco Time Machine limpio, recién formateado, usa Utilidad de Disco y haz un restore (fuente: Install DVD; Destino: disco Time Machine). Una vez completado, tendrás un disco de Time Machine con el que se puede iniciar un ordenador, que se puede seleccionar en el arranque apretando y manteniendo presionada la tecla Option. Todo lo que queda es entrar en las preferencias de Time Machine y escoger este disco para tus copias de respaldo de Time Machine.

Simple y rápido, sin necesidad de hacer particiones en el disco.

Fuente: MacOSXHints